A principios de 1965, en desarrollo del objetivo ya mencionado según el cual los almacenes de depósito son indispensables para la defensa de la industria cafetera y el efectivo manejo de la cadena de comercialización externa e interna del café, la Federación decidió crear los Almacenes Generales de Depósito de Café -  Almacafé S.A.

Almacafé como empresa de Servicios Financieros vigilada por la Superintendencia Financiera, tiene la capacidad de expedir certificados de depósito y bonos de prenda sobre las mercancías almacenadas y por consiguiente efectuar todas las operaciones que por ley los Almacenes Generales de Depósito, están autorizados.

En desarrollo de su objeto social y contribuyendo al logro de sus objetivos estratégicos, propósitos y estrategias, Almacafé se constituye en una empresa de servicios de naturaleza logística con características estratégicas y de gestión propia, que ejerce funciones delegadas por la Federación y presta servicios de Operador Logístico a otros clientes y productos.

La credibilidad, la transparencia, el buen gobierno, el cumplimiento integral de la normatividad vigente y de los compromisos adquiridos para el manejo de la logística en la comercialización del café, son fortalezas para proyectar la calidad de nuestros servicios a otros clientes y productos, basados en los principios de calidad, precios competitivos, valor agregado, oportunidad y vocación de servicio.

 Para el desarrollo y atención de la logística del café y otro tipo de productos, se cuenta con una Oficina Principal con sede en la ciudad de Bogotá, junto con 15 Sucursales y Agencias a nivel nacional. Exclusivamente para el café, Almacafé administra 9 plantas industriales, especializadas en la trilla de café de exportación y una torrefactora para la producción y empaque de este producto.